我科學家繪制首個公豬完整基因組圖譜
2025年12月25日09:16 | 來源:科技日報
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記者12月17日從中國農業大學動物科學技術學院獲悉,該院教授方美英團隊在國際期刊《自然·遺傳》發表最新成果,發布了全球首個公豬T2T(端粒到端粒)完整基因組(T2T-pig1.0)。該研究為豬基因組研究提供了關鍵基礎數據,對豬品種改良具有重要指導意義,同時拓展了豬作為生物醫學研究模式動物的應用前景。
家豬自約1萬年前被馴化以來,已成為全球重要的農用動物和生物醫學研究模式動物。然而,受測序技術限制,豬參考基因組在重復序列富集區域仍存在數百個缺口尚未解析,如著絲粒和Y染色體異染色質區。此外,由於缺乏高質量、完整的家豬基因組資源,其基因組進化機制及決定其獨特性狀的關鍵突變研究仍缺乏重要基因組資源支撐。
該研究以中國五指山小型豬為模型,首次完成了公豬端粒到端粒無間隙基因組組裝,其中包含完整的Y染色體和著絲粒區域。論文共同通訊作者方美英告訴記者,該研究構建了一個包括26.3億個鹼基對、質量值達到51.41的無缺口T2T基因組。與現有參考基因組相比,該基因組新增解析區域1億9442萬個鹼基對,其中包含1189個基因。基於基因組分析,該研究發現了亞洲豬基因組的3種主要祖源成分,並確認東北亞豬種存在歐洲豬遺傳成分,更加精准地揭示了家豬群體的遺傳結構及亞洲豬群間的基因滲入關系。
“此外,本研究在中國五指山小型豬基因組中發現了133個受到強烈選擇的新基因,它們可能與其小體型性狀相關。研究還首次解析了多肽N-乙酰氨基半乳糖轉移酶13基因調控體型性狀的機制,為小體型豬培育提供了基因素材。”方美英說。(記者馬愛平)
(責編:郝孟佳、劉凡)
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